A clinical trials corpus annotated with UMLS entities to enhance the access to evidence-based medicine [Borrador]

Colección de 1200 textos (292 173 tokens) sobre estudios de ensayos clínicos y anuncios de ensayos clínicos en español: - 500 resúmenes de revistas publicadas bajo licencia Creative Commons disponibles, por ejemplo, en PubMed o Scientific Electronic Library Online (SciELO). - 700 anuncios de ensayos clínicos publicados en el Registro Europeo de Ensayos Clínicos y el Repositorio Español de Estudios Clínicos. Los textos fueron anotados con entidades de los grupos semánticos del Sistema Unificado de Lenguaje Médico: anatomía (ANAT), sustancias farmacológicas y químicas (CHEM), patologías (DISO) y pruebas de laboratorio, procedimientos diagnósticos o terapéuticos (PROC). Se anotaron 46 699 entidades (13,98% son entidades anidadas). El 10% del corpus fue doblemente anotado y la concordancia entre anotadores (IAA) logró una medida F media del 85,65% (±4,79, coincidencia estricta) y una medida F media del 93,94% (±3,31, coincidencia relajada).

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Cita recomendada: A clinical trials corpus annotated with UMLS© entities to enhance the access to Evidence-Based Medicine Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, Adrián Capllonch-Carrión, Antonio Moreno-Sandoval BMC Medical Informatics and Decision Making (2021) DOI: 10.1186/s12911-021-01395-z