Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "Observaciones": {
2
  "Observaciones": {
            
3
    "en": "Recomended citation: A clinical trials corpus annotated 
3
    "en": "Recomended citation: A clinical trials corpus annotated 
            
4
with UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based 
4
with UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based 
            
n
5
Medicine\r\n    Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, 
n
5
Medicine. Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, Adri\u00e1n 
            
6
Adri\u00e1n Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval\r\n    BMC 
6
Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval. BMC Medical 
            
7
Medical Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
7
Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
            
8
10.1186/s12911-021-01395-z",
8
10.1186/s12911-021-01395-z",
            
9
    "es": "Cita recomendada: A clinical trials corpus annotated with 
9
    "es": "Cita recomendada: A clinical trials corpus annotated with 
            
n
10
UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based 
n
10
UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based Medicine. 
            
11
Medicine\r\n    Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, 
11
Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, Adri\u00e1n 
            
12
Adri\u00e1n Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval\r\n    BMC 
12
Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval\r\nBMC Medical 
            
13
Medical Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
13
Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
            
14
10.1186/s12911-021-01395-z"
14
10.1186/s12911-021-01395-z"
            
15
  },
15
  },
            
16
  "author": null,
16
  "author": null,
            
17
  "author_email": null,
17
  "author_email": null,
            
18
  "autor": {
18
  "autor": {
            
19
    "en": [
19
    "en": [
            
20
      "Leonardo Campillos-Llanos",
20
      "Leonardo Campillos-Llanos",
            
21
      "Ana Valverde Mateos",
21
      "Ana Valverde Mateos",
            
22
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
22
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
            
23
      "Antonio Moreno Sandoval"
23
      "Antonio Moreno Sandoval"
            
24
    ],
24
    ],
            
25
    "es": [
25
    "es": [
            
26
      "Leonardo Campillos-Llanos",
26
      "Leonardo Campillos-Llanos",
            
27
      "Ana Valverde Mateos",
27
      "Ana Valverde Mateos",
            
28
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
28
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
            
29
      "Antonio Moreno Sandoval"
29
      "Antonio Moreno Sandoval"
            
30
    ]
30
    ]
            
31
  },
31
  },
            
32
  "conforms_to": [],
32
  "conforms_to": [],
            
33
  "coverage_new": {},
33
  "coverage_new": {},
            
34
  "creator_user_id": "196556b3-e0c4-4c51-a9e6-f51cc752bc37",
34
  "creator_user_id": "196556b3-e0c4-4c51-a9e6-f51cc752bc37",
            
35
  "description": {
35
  "description": {
            
36
    "en": "A collection of 1200 texts (292 173 tokens) about clinical 
36
    "en": "A collection of 1200 texts (292 173 tokens) about clinical 
            
37
trials studies and clinical trials announcements in Spanish: - 500 
37
trials studies and clinical trials announcements in Spanish: - 500 
            
38
abstracts from journals published under a Creative Commons license, 
38
abstracts from journals published under a Creative Commons license, 
            
39
e.g. available in PubMed or the Scientific Electronic Library Online 
39
e.g. available in PubMed or the Scientific Electronic Library Online 
            
40
(SciELO). - 700 clinical trials announcements published in the 
40
(SciELO). - 700 clinical trials announcements published in the 
            
41
European Clinical Trials Register and Repositorio Espa\u00f1ol de 
41
European Clinical Trials Register and Repositorio Espa\u00f1ol de 
            
42
Estudios Cl\u00ednicos. Texts were annotated with entities from the 
42
Estudios Cl\u00ednicos. Texts were annotated with entities from the 
            
43
Unified Medical Language System semantic groups: anatomy (ANAT), 
43
Unified Medical Language System semantic groups: anatomy (ANAT), 
            
44
pharmacological and chemical substances (CHEM), pathologies (DISO), 
44
pharmacological and chemical substances (CHEM), pathologies (DISO), 
            
45
and lab tests, diagnostic or therapeutic procedures (PROC). 46 699 
45
and lab tests, diagnostic or therapeutic procedures (PROC). 46 699 
            
46
entities were annotated (13.98% are nested entities). 10% of the 
46
entities were annotated (13.98% are nested entities). 10% of the 
            
47
corpus was doubly annotated, and inter-annotator agreement (IAA) 
47
corpus was doubly annotated, and inter-annotator agreement (IAA) 
            
48
achieved a mean F-measure of 85.65% (\u00b14.79, strict match) and a 
48
achieved a mean F-measure of 85.65% (\u00b14.79, strict match) and a 
            
49
mean F-measure of 93.94% (\u00b13.31, relaxed match).",
49
mean F-measure of 93.94% (\u00b13.31, relaxed match).",
            
50
    "es": "Colecci\u00f3n de 1200 textos (292 173 tokens) sobre 
50
    "es": "Colecci\u00f3n de 1200 textos (292 173 tokens) sobre 
            
51
estudios de ensayos cl\u00ednicos y anuncios de ensayos cl\u00ednicos 
51
estudios de ensayos cl\u00ednicos y anuncios de ensayos cl\u00ednicos 
            
52
en espa\u00f1ol: - 500 res\u00famenes de revistas publicadas bajo 
52
en espa\u00f1ol: - 500 res\u00famenes de revistas publicadas bajo 
            
53
licencia Creative Commons disponibles, por ejemplo, en PubMed o 
53
licencia Creative Commons disponibles, por ejemplo, en PubMed o 
            
54
Scientific Electronic Library Online (SciELO). - 700 anuncios de 
54
Scientific Electronic Library Online (SciELO). - 700 anuncios de 
            
55
ensayos cl\u00ednicos publicados en el Registro Europeo de Ensayos 
55
ensayos cl\u00ednicos publicados en el Registro Europeo de Ensayos 
            
56
Cl\u00ednicos y el Repositorio Espa\u00f1ol de Estudios Cl\u00ednicos. 
56
Cl\u00ednicos y el Repositorio Espa\u00f1ol de Estudios Cl\u00ednicos. 
            
57
Los textos fueron anotados con entidades de los grupos sem\u00e1nticos 
57
Los textos fueron anotados con entidades de los grupos sem\u00e1nticos 
            
58
del Sistema Unificado de Lenguaje M\u00e9dico: anatom\u00eda (ANAT), 
58
del Sistema Unificado de Lenguaje M\u00e9dico: anatom\u00eda (ANAT), 
            
59
sustancias farmacol\u00f3gicas y qu\u00edmicas (CHEM), patolog\u00edas 
59
sustancias farmacol\u00f3gicas y qu\u00edmicas (CHEM), patolog\u00edas 
            
60
(DISO) y pruebas de laboratorio, procedimientos diagn\u00f3sticos o 
60
(DISO) y pruebas de laboratorio, procedimientos diagn\u00f3sticos o 
            
61
terap\u00e9uticos (PROC). Se anotaron 46 699 entidades (13,98% son 
61
terap\u00e9uticos (PROC). Se anotaron 46 699 entidades (13,98% son 
            
62
entidades anidadas). El 10% del corpus fue doblemente anotado y la 
62
entidades anidadas). El 10% del corpus fue doblemente anotado y la 
            
63
concordancia entre anotadores (IAA) logr\u00f3 una medida F media del 
63
concordancia entre anotadores (IAA) logr\u00f3 una medida F media del 
            
64
85,65% (\u00b14,79, coincidencia estricta) y una medida F media del 
64
85,65% (\u00b14,79, coincidencia estricta) y una medida F media del 
            
65
93,94% (\u00b13,31, coincidencia relajada)."
65
93,94% (\u00b13,31, coincidencia relajada)."
            
66
  },
66
  },
            
67
  "groups": [
67
  "groups": [
            
68
    {
68
    {
            
69
      "description": "",
69
      "description": "",
            
70
      "display_name": "Ling\u00fc\u00edstica",
70
      "display_name": "Ling\u00fc\u00edstica",
            
71
      "id": "372aa551-b8e2-47fd-bc5e-0f807f9b09d6",
71
      "id": "372aa551-b8e2-47fd-bc5e-0f807f9b09d6",
            
72
      "image_display_url": 
72
      "image_display_url": 
            
73
s.cchs.csic.es/uploads/group/2024-09-24-155551.755581Linguistica.png",
73
s.cchs.csic.es/uploads/group/2024-09-24-155551.755581Linguistica.png",
            
74
      "name": "linguistica",
74
      "name": "linguistica",
            
75
      "title": "Ling\u00fc\u00edstica"
75
      "title": "Ling\u00fc\u00edstica"
            
76
    },
76
    },
            
77
    {
77
    {
            
78
      "description": "",
78
      "description": "",
            
79
      "display_name": "Tecnolog\u00edas del lenguaje",
79
      "display_name": "Tecnolog\u00edas del lenguaje",
            
80
      "id": "f50a92b2-8774-4390-82dd-5c080b098961",
80
      "id": "f50a92b2-8774-4390-82dd-5c080b098961",
            
81
      "image_display_url": 
81
      "image_display_url": 
            
82
s/uploads/group/2024-09-27-062643.156350Tecnologias-del-lenguaje.png",
82
s/uploads/group/2024-09-27-062643.156350Tecnologias-del-lenguaje.png",
            
83
      "name": "tecnologias-del-lenguaje",
83
      "name": "tecnologias-del-lenguaje",
            
84
      "title": "Tecnolog\u00edas del lenguaje"
84
      "title": "Tecnolog\u00edas del lenguaje"
            
85
    }
85
    }
            
86
  ],
86
  ],
            
87
  "id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
87
  "id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
            
88
  "identifier": "http://hdl.handle.net/10261/285045",
88
  "identifier": "http://hdl.handle.net/10261/285045",
            
89
  "international_spatial_translated": {
89
  "international_spatial_translated": {
            
n
90
    "en": "",
n
90
    "en": "Europe",
            
91
    "es": ""
91
    "es": "Europa"
            
92
  },
92
  },
            
93
  "isopen": false,
93
  "isopen": false,
            
94
  "issued_date": "2021-02-22T00:00:00",
94
  "issued_date": "2021-02-22T00:00:00",
            
95
  "language": [
95
  "language": [
            
96
    "es",
96
    "es",
            
97
    "en"
97
    "en"
            
98
  ],
98
  ],
            
99
  "license_id": "https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
99
  "license_id": "https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
            
100
  "license_title": 
100
  "license_title": 
            
101
"https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
101
"https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
            
102
  "maintainer": null,
102
  "maintainer": null,
            
103
  "maintainer_email": null,
103
  "maintainer_email": null,
            
104
  "metadata_created": "2025-03-04T15:43:09.650331",
104
  "metadata_created": "2025-03-04T15:43:09.650331",
            
n
105
  "metadata_modified": "2025-03-04T16:23:54.720964",
n
105
  "metadata_modified": "2025-03-05T07:46:10.854885",
            
106
  "modified_date": "2021-02-22T00:00:00",
106
  "modified_date": "2021-02-22T00:00:00",
            
107
  "multilingual_tags": {
107
  "multilingual_tags": {
            
108
    "en": [
108
    "en": [
            
n
109
      "Open Access",
n

            
110
      "Clinical trials",
109
      "Clinical trials",
            
111
      "Evidence-Based Medicine",
110
      "Evidence-Based Medicine",
            
112
      "Semantic Annotation",
111
      "Semantic Annotation",
            
113
      "Inter-Annotator Agreement",
112
      "Inter-Annotator Agreement",
            
114
      "Natural Language Processing"
113
      "Natural Language Processing"
            
n
n
114
    ],
            
115
    "es": [
            
116
      "Ensayos cl\u00ednicos",
            
117
      "Evidencia m\u00e9dicas",
            
118
      "Anotaci\u00f3n sem\u00e1ntica",
            
119
      "Procesamiento del Lenguaje Natural"
            
115
    ]
120
    ]
            
116
  },
121
  },
            
117
  "name": 
122
  "name": 
            
118
notated-with-umls-entities-to-enhance-the-access-to-evidence-based-m",
123
notated-with-umls-entities-to-enhance-the-access-to-evidence-based-m",
            
119
  "notes": null,
124
  "notes": null,
            
120
  "num_resources": 2,
125
  "num_resources": 2,
            
121
  "num_tags": 0,
126
  "num_tags": 0,
            
122
  "organization": {
127
  "organization": {
            
123
    "approval_status": "approved",
128
    "approval_status": "approved",
            
124
    "created": "2023-09-25T12:13:42.172869",
129
    "created": "2023-09-25T12:13:42.172869",
            
125
    "description": "El Instituto de Lengua, Literatura y 
130
    "description": "El Instituto de Lengua, Literatura y 
            
126
Antropolog\u00eda, ILLA (CSIC) tiene como objetivo primordial la 
131
Antropolog\u00eda, ILLA (CSIC) tiene como objetivo primordial la 
            
127
investigaci\u00f3n del patrimonio cultural hisp\u00e1nico en su triple 
132
investigaci\u00f3n del patrimonio cultural hisp\u00e1nico en su triple 
            
128
dimensi\u00f3n antropol\u00f3gica, ling\u00fc\u00edstica y 
133
dimensi\u00f3n antropol\u00f3gica, ling\u00fc\u00edstica y 
            
129
literaria.",
134
literaria.",
            
130
    "id": "fc47e531-a165-4eac-8fc7-34342a3a38ff",
135
    "id": "fc47e531-a165-4eac-8fc7-34342a3a38ff",
            
131
    "image_url": "2023-09-25-101342.167134illa0.png",
136
    "image_url": "2023-09-25-101342.167134illa0.png",
            
132
    "is_organization": true,
137
    "is_organization": true,
            
133
    "name": "instituto-de-lengua-literatura-y-antropologia-illa-csic",
138
    "name": "instituto-de-lengua-literatura-y-antropologia-illa-csic",
            
134
    "state": "active",
139
    "state": "active",
            
135
    "title": "Instituto de Lengua, Literatura y Antropolog\u00eda 
140
    "title": "Instituto de Lengua, Literatura y Antropolog\u00eda 
            
136
(ILLA), CSIC",
141
(ILLA), CSIC",
            
137
    "type": "organization"
142
    "type": "organization"
            
138
  },
143
  },
            
139
  "owner_org": "fc47e531-a165-4eac-8fc7-34342a3a38ff",
144
  "owner_org": "fc47e531-a165-4eac-8fc7-34342a3a38ff",
            
140
  "private": false,
145
  "private": false,
            
141
  "proyecto": {},
146
  "proyecto": {},
            
142
  "publisher": "b627d71d-2315-4e75-afc9-897da84459f0",
147
  "publisher": "b627d71d-2315-4e75-afc9-897da84459f0",
            
143
  "reference": [],
148
  "reference": [],
            
144
  "relationships_as_object": [],
149
  "relationships_as_object": [],
            
145
  "relationships_as_subject": [],
150
  "relationships_as_subject": [],
            
146
  "resources": [
151
  "resources": [
            
147
    {
152
    {
            
148
      "byte_size": "8,07 kB",
153
      "byte_size": "8,07 kB",
            
149
      "cache_last_updated": null,
154
      "cache_last_updated": null,
            
150
      "cache_url": null,
155
      "cache_url": null,
            
151
      "created": "2025-03-04T15:44:08.808809",
156
      "created": "2025-03-04T15:44:08.808809",
            
152
      "datastore_active": false,
157
      "datastore_active": false,
            
153
      "description": null,
158
      "description": null,
            
154
      "format": "txt",
159
      "format": "txt",
            
155
      "hash": "",
160
      "hash": "",
            
156
      "id": "74a37986-f9d9-4084-a3f2-3f101dd6966d",
161
      "id": "74a37986-f9d9-4084-a3f2-3f101dd6966d",
            
157
      "last_modified": null,
162
      "last_modified": null,
            
158
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.309817",
163
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.309817",
            
159
      "mimetype": "text/plain",
164
      "mimetype": "text/plain",
            
160
      "mimetype_inner": null,
165
      "mimetype_inner": null,
            
161
      "name": "README.txt",
166
      "name": "README.txt",
            
162
      "name_translated": {
167
      "name_translated": {
            
163
        "en": "README.txt",
168
        "en": "README.txt",
            
164
        "es": "README.txt"
169
        "es": "README.txt"
            
165
      },
170
      },
            
166
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
171
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
            
167
      "position": 0,
172
      "position": 0,
            
168
      "resource_identifier": 
173
      "resource_identifier": 
            
169
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
174
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
            
170
      "resource_relation": [],
175
      "resource_relation": [],
            
171
      "resource_relation-1": "",
176
      "resource_relation-1": "",
            
172
      "resource_relation-2": "",
177
      "resource_relation-2": "",
            
173
      "resource_type": null,
178
      "resource_type": null,
            
174
      "size": null,
179
      "size": null,
            
175
      "state": "active",
180
      "state": "active",
            
176
      "url": 
181
      "url": 
            
177
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
182
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
            
178
      "url_type": null
183
      "url_type": null
            
179
    },
184
    },
            
180
    {
185
    {
            
181
      "byte_size": "2,52 MB",
186
      "byte_size": "2,52 MB",
            
182
      "cache_last_updated": null,
187
      "cache_last_updated": null,
            
183
      "cache_url": null,
188
      "cache_url": null,
            
184
      "created": "2025-03-04T15:44:45.312097",
189
      "created": "2025-03-04T15:44:45.312097",
            
185
      "datastore_active": false,
190
      "datastore_active": false,
            
186
      "description": null,
191
      "description": null,
            
187
      "format": "zip",
192
      "format": "zip",
            
188
      "hash": "",
193
      "hash": "",
            
189
      "id": "7251e3a1-561d-45f8-bc92-b4f9c1b7e379",
194
      "id": "7251e3a1-561d-45f8-bc92-b4f9c1b7e379",
            
190
      "last_modified": null,
195
      "last_modified": null,
            
191
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.431908",
196
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.431908",
            
192
      "mimetype": "application/zip",
197
      "mimetype": "application/zip",
            
193
      "mimetype_inner": null,
198
      "mimetype_inner": null,
            
194
      "name": "CT-EBM-SP.zip",
199
      "name": "CT-EBM-SP.zip",
            
195
      "name_translated": {
200
      "name_translated": {
            
196
        "en": "CT-EBM-SP.zip",
201
        "en": "CT-EBM-SP.zip",
            
197
        "es": "CT-EBM-SP.zip"
202
        "es": "CT-EBM-SP.zip"
            
198
      },
203
      },
            
199
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
204
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
            
200
      "position": 1,
205
      "position": 1,
            
201
      "resource_identifier": 
206
      "resource_identifier": 
            
202
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
207
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
            
203
      "resource_relation": [],
208
      "resource_relation": [],
            
204
      "resource_relation-1": "",
209
      "resource_relation-1": "",
            
205
      "resource_type": null,
210
      "resource_type": null,
            
206
      "size": null,
211
      "size": null,
            
207
      "state": "active",
212
      "state": "active",
            
208
      "url": 
213
      "url": 
            
209
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
214
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
            
210
      "url_type": null
215
      "url_type": null
            
211
    }
216
    }
            
212
  ],
217
  ],
            
n
213
  "spatial": [],
n
218
  "spatial": [
            
219
    
            
220
ttp://datos.gob.es/recurso/sector-publico/territorio/Pais/Espa\u00f1a"
            
221
  ],
            
214
  "state": "active",
222
  "state": "active",
            
215
  "tags": [],
223
  "tags": [],
            
216
  "theme": [
224
  "theme": [
            
217
    
225
    
            
218
"http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/ciencia-tecnologia",
226
"http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/ciencia-tecnologia",
            
219
    "http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/salud"
227
    "http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/salud"
            
220
  ],
228
  ],
            
n
221
  "title": "A clinical trials corpus annotated with UMLS entities to 
n
229
  "title": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
            
222
enhance the access to evidence-based medicine",
230
Evidence-Based-Medicine in Spanish",
            
223
  "title_translated": {
231
  "title_translated": {
            
224
    "en": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
232
    "en": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
            
225
Evidence-Based-Medicine in Spanish",
233
Evidence-Based-Medicine in Spanish",
            
t
226
    "es": "A clinical trials corpus annotated with UMLS entities to 
t
234
    "es": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
            
227
enhance the access to evidence-based medicine"
235
Evidence-Based-Medicine in Spanish"
            
228
  },
236
  },
            
229
  "type": "dataset",
237
  "type": "dataset",
            
230
  "url": null,
238
  "url": null,
            
231
  "version": null
239
  "version": null
            
232
}
240
}