Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "Observaciones": {
2
  "Observaciones": {
            
3
    "en": "Recomended citation: A clinical trials corpus annotated 
3
    "en": "Recomended citation: A clinical trials corpus annotated 
            
4
with UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based 
4
with UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based 
            
5
Medicine. Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, Adri\u00e1n 
5
Medicine. Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, Adri\u00e1n 
            
6
Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval. BMC Medical 
6
Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval. BMC Medical 
            
7
Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
7
Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
            
8
10.1186/s12911-021-01395-z",
8
10.1186/s12911-021-01395-z",
            
9
    "es": "Cita recomendada: A clinical trials corpus annotated with 
9
    "es": "Cita recomendada: A clinical trials corpus annotated with 
            
10
UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based Medicine. 
10
UMLS\u00a9 entities to enhance the access to Evidence-Based Medicine. 
            
11
Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, Adri\u00e1n 
11
Leonardo Campillos-Llanos, Ana Valverde-Mateos, Adri\u00e1n 
            
12
Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval\r\nBMC Medical 
12
Capllonch-Carri\u00f3n, Antonio Moreno-Sandoval\r\nBMC Medical 
            
13
Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
13
Informatics and Decision Making (2021) DOI: 
            
14
10.1186/s12911-021-01395-z"
14
10.1186/s12911-021-01395-z"
            
15
  },
15
  },
            
16
  "author": null,
16
  "author": null,
            
17
  "author_email": null,
17
  "author_email": null,
            
18
  "autor": {
18
  "autor": {
            
19
    "en": [
19
    "en": [
            
20
      "Leonardo Campillos-Llanos",
20
      "Leonardo Campillos-Llanos",
            
21
      "Ana Valverde Mateos",
21
      "Ana Valverde Mateos",
            
22
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
22
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
            
23
      "Antonio Moreno Sandoval"
23
      "Antonio Moreno Sandoval"
            
24
    ],
24
    ],
            
25
    "es": [
25
    "es": [
            
26
      "Leonardo Campillos-Llanos",
26
      "Leonardo Campillos-Llanos",
            
27
      "Ana Valverde Mateos",
27
      "Ana Valverde Mateos",
            
28
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
28
      "Adri\u00e1n Capllonch Carri\u00f3n",
            
29
      "Antonio Moreno Sandoval"
29
      "Antonio Moreno Sandoval"
            
30
    ]
30
    ]
            
31
  },
31
  },
            
32
  "conforms_to": [],
32
  "conforms_to": [],
            
33
  "coverage_new": {},
33
  "coverage_new": {},
            
34
  "creator_user_id": "196556b3-e0c4-4c51-a9e6-f51cc752bc37",
34
  "creator_user_id": "196556b3-e0c4-4c51-a9e6-f51cc752bc37",
            
35
  "description": {
35
  "description": {
            
36
    "en": "A collection of 1200 texts (292 173 tokens) about clinical 
36
    "en": "A collection of 1200 texts (292 173 tokens) about clinical 
            
37
trials studies and clinical trials announcements in Spanish: - 500 
37
trials studies and clinical trials announcements in Spanish: - 500 
            
38
abstracts from journals published under a Creative Commons license, 
38
abstracts from journals published under a Creative Commons license, 
            
39
e.g. available in PubMed or the Scientific Electronic Library Online 
39
e.g. available in PubMed or the Scientific Electronic Library Online 
            
40
(SciELO). - 700 clinical trials announcements published in the 
40
(SciELO). - 700 clinical trials announcements published in the 
            
41
European Clinical Trials Register and Repositorio Espa\u00f1ol de 
41
European Clinical Trials Register and Repositorio Espa\u00f1ol de 
            
42
Estudios Cl\u00ednicos. Texts were annotated with entities from the 
42
Estudios Cl\u00ednicos. Texts were annotated with entities from the 
            
43
Unified Medical Language System semantic groups: anatomy (ANAT), 
43
Unified Medical Language System semantic groups: anatomy (ANAT), 
            
44
pharmacological and chemical substances (CHEM), pathologies (DISO), 
44
pharmacological and chemical substances (CHEM), pathologies (DISO), 
            
45
and lab tests, diagnostic or therapeutic procedures (PROC). 46 699 
45
and lab tests, diagnostic or therapeutic procedures (PROC). 46 699 
            
46
entities were annotated (13.98% are nested entities). 10% of the 
46
entities were annotated (13.98% are nested entities). 10% of the 
            
47
corpus was doubly annotated, and inter-annotator agreement (IAA) 
47
corpus was doubly annotated, and inter-annotator agreement (IAA) 
            
48
achieved a mean F-measure of 85.65% (\u00b14.79, strict match) and a 
48
achieved a mean F-measure of 85.65% (\u00b14.79, strict match) and a 
            
49
mean F-measure of 93.94% (\u00b13.31, relaxed match).",
49
mean F-measure of 93.94% (\u00b13.31, relaxed match).",
            
50
    "es": "Colecci\u00f3n de 1200 textos (292 173 tokens) sobre 
50
    "es": "Colecci\u00f3n de 1200 textos (292 173 tokens) sobre 
            
51
estudios de ensayos cl\u00ednicos y anuncios de ensayos cl\u00ednicos 
51
estudios de ensayos cl\u00ednicos y anuncios de ensayos cl\u00ednicos 
            
52
en espa\u00f1ol: - 500 res\u00famenes de revistas publicadas bajo 
52
en espa\u00f1ol: - 500 res\u00famenes de revistas publicadas bajo 
            
53
licencia Creative Commons disponibles, por ejemplo, en PubMed o 
53
licencia Creative Commons disponibles, por ejemplo, en PubMed o 
            
54
Scientific Electronic Library Online (SciELO). - 700 anuncios de 
54
Scientific Electronic Library Online (SciELO). - 700 anuncios de 
            
55
ensayos cl\u00ednicos publicados en el Registro Europeo de Ensayos 
55
ensayos cl\u00ednicos publicados en el Registro Europeo de Ensayos 
            
56
Cl\u00ednicos y el Repositorio Espa\u00f1ol de Estudios Cl\u00ednicos. 
56
Cl\u00ednicos y el Repositorio Espa\u00f1ol de Estudios Cl\u00ednicos. 
            
57
Los textos fueron anotados con entidades de los grupos sem\u00e1nticos 
57
Los textos fueron anotados con entidades de los grupos sem\u00e1nticos 
            
58
del Sistema Unificado de Lenguaje M\u00e9dico: anatom\u00eda (ANAT), 
58
del Sistema Unificado de Lenguaje M\u00e9dico: anatom\u00eda (ANAT), 
            
59
sustancias farmacol\u00f3gicas y qu\u00edmicas (CHEM), patolog\u00edas 
59
sustancias farmacol\u00f3gicas y qu\u00edmicas (CHEM), patolog\u00edas 
            
60
(DISO) y pruebas de laboratorio, procedimientos diagn\u00f3sticos o 
60
(DISO) y pruebas de laboratorio, procedimientos diagn\u00f3sticos o 
            
61
terap\u00e9uticos (PROC). Se anotaron 46 699 entidades (13,98% son 
61
terap\u00e9uticos (PROC). Se anotaron 46 699 entidades (13,98% son 
            
62
entidades anidadas). El 10% del corpus fue doblemente anotado y la 
62
entidades anidadas). El 10% del corpus fue doblemente anotado y la 
            
63
concordancia entre anotadores (IAA) logr\u00f3 una medida F media del 
63
concordancia entre anotadores (IAA) logr\u00f3 una medida F media del 
            
64
85,65% (\u00b14,79, coincidencia estricta) y una medida F media del 
64
85,65% (\u00b14,79, coincidencia estricta) y una medida F media del 
            
65
93,94% (\u00b13,31, coincidencia relajada)."
65
93,94% (\u00b13,31, coincidencia relajada)."
            
66
  },
66
  },
            
67
  "groups": [
67
  "groups": [
            
68
    {
68
    {
            
69
      "description": "",
69
      "description": "",
            
70
      "display_name": "Ling\u00fc\u00edstica",
70
      "display_name": "Ling\u00fc\u00edstica",
            
71
      "id": "372aa551-b8e2-47fd-bc5e-0f807f9b09d6",
71
      "id": "372aa551-b8e2-47fd-bc5e-0f807f9b09d6",
            
72
      "image_display_url": 
72
      "image_display_url": 
            
73
s.cchs.csic.es/uploads/group/2024-09-24-155551.755581Linguistica.png",
73
s.cchs.csic.es/uploads/group/2024-09-24-155551.755581Linguistica.png",
            
74
      "name": "linguistica",
74
      "name": "linguistica",
            
75
      "title": "Ling\u00fc\u00edstica"
75
      "title": "Ling\u00fc\u00edstica"
            
76
    },
76
    },
            
77
    {
77
    {
            
78
      "description": "",
78
      "description": "",
            
79
      "display_name": "Tecnolog\u00edas del lenguaje",
79
      "display_name": "Tecnolog\u00edas del lenguaje",
            
80
      "id": "f50a92b2-8774-4390-82dd-5c080b098961",
80
      "id": "f50a92b2-8774-4390-82dd-5c080b098961",
            
81
      "image_display_url": 
81
      "image_display_url": 
            
82
s/uploads/group/2024-09-27-062643.156350Tecnologias-del-lenguaje.png",
82
s/uploads/group/2024-09-27-062643.156350Tecnologias-del-lenguaje.png",
            
83
      "name": "tecnologias-del-lenguaje",
83
      "name": "tecnologias-del-lenguaje",
            
84
      "title": "Tecnolog\u00edas del lenguaje"
84
      "title": "Tecnolog\u00edas del lenguaje"
            
85
    },
85
    },
            
86
    {
86
    {
            
87
      "description": "",
87
      "description": "",
            
88
      "display_name": "Terminolog\u00eda",
88
      "display_name": "Terminolog\u00eda",
            
89
      "id": "f21d51d4-df60-44f9-ad1f-60f1d5ca24d2",
89
      "id": "f21d51d4-df60-44f9-ad1f-60f1d5ca24d2",
            
90
      "image_display_url": 
90
      "image_display_url": 
            
91
.cchs.csic.es/uploads/group/2024-09-27-062713.009717Terminologia.png",
91
.cchs.csic.es/uploads/group/2024-09-27-062713.009717Terminologia.png",
            
92
      "name": "terminologia",
92
      "name": "terminologia",
            
93
      "title": "Terminolog\u00eda"
93
      "title": "Terminolog\u00eda"
            
94
    }
94
    }
            
95
  ],
95
  ],
            
96
  "id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
96
  "id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
            
97
  "identifier": "http://hdl.handle.net/10261/285045",
97
  "identifier": "http://hdl.handle.net/10261/285045",
            
98
  "instituto": [
98
  "instituto": [
            
99
    "Instituto de Lengua, Literatura y Antropolog\u00eda (ILLA), CSIC"
99
    "Instituto de Lengua, Literatura y Antropolog\u00eda (ILLA), CSIC"
            
100
  ],
100
  ],
            
101
  "international_spatial_translated": {
101
  "international_spatial_translated": {
            
102
    "en": "",
102
    "en": "",
            
103
    "es": ""
103
    "es": ""
            
104
  },
104
  },
            
105
  "isopen": false,
105
  "isopen": false,
            
106
  "issued_date": "2021-02-22T00:00:00",
106
  "issued_date": "2021-02-22T00:00:00",
            
107
  "language": [
107
  "language": [
            
108
    "es",
108
    "es",
            
109
    "en"
109
    "en"
            
110
  ],
110
  ],
            
111
  "license_id": "https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
111
  "license_id": "https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
            
112
  "license_title": 
112
  "license_title": 
            
113
"https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
113
"https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/",
            
114
  "maintainer": null,
114
  "maintainer": null,
            
115
  "maintainer_email": null,
115
  "maintainer_email": null,
            
116
  "metadata_created": "2025-03-04T15:43:09.650331",
116
  "metadata_created": "2025-03-04T15:43:09.650331",
            
n
117
  "metadata_modified": "2025-04-16T06:50:23.055621",
n
117
  "metadata_modified": "2025-10-03T06:32:20.784553",
            
118
  "modified_date": "2021-02-22T00:00:00",
118
  "modified_date": "2021-02-22T00:00:00",
            
119
  "multilingual_tags": {
119
  "multilingual_tags": {
            
120
    "en": [
120
    "en": [
            
121
      "Clinical trials",
121
      "Clinical trials",
            
122
      "Evidence-Based Medicine",
122
      "Evidence-Based Medicine",
            
123
      "Semantic Annotation",
123
      "Semantic Annotation",
            
124
      "Inter-Annotator Agreement",
124
      "Inter-Annotator Agreement",
            
125
      "Natural Language Processing"
125
      "Natural Language Processing"
            
126
    ],
126
    ],
            
127
    "es": [
127
    "es": [
            
128
      "Ensayos cl\u00ednicos",
128
      "Ensayos cl\u00ednicos",
            
129
      "Evidencia m\u00e9dicas",
129
      "Evidencia m\u00e9dicas",
            
130
      "Anotaci\u00f3n sem\u00e1ntica",
130
      "Anotaci\u00f3n sem\u00e1ntica",
            
131
      "Procesamiento del Lenguaje Natural"
131
      "Procesamiento del Lenguaje Natural"
            
132
    ]
132
    ]
            
133
  },
133
  },
            
134
  "name": 
134
  "name": 
            
135
notated-with-umls-entities-to-enhance-the-access-to-evidence-based-m",
135
notated-with-umls-entities-to-enhance-the-access-to-evidence-based-m",
            
136
  "notes": null,
136
  "notes": null,
            
137
  "num_resources": 2,
137
  "num_resources": 2,
            
138
  "num_tags": 0,
138
  "num_tags": 0,
            
139
  "organization": {
139
  "organization": {
            
140
    "approval_status": "approved",
140
    "approval_status": "approved",
            
141
    "created": "2025-04-15T15:18:43.186369",
141
    "created": "2025-04-15T15:18:43.186369",
            
n
142
    "description": "",
n
142
    "description": "Agencia Estatal Consejo Superior de 
            
143
Investigaciones Cient\u00edficas",
            
143
    "id": "e0fb512f-fa1e-43d9-ba1e-22b1f834702e",
144
    "id": "e0fb512f-fa1e-43d9-ba1e-22b1f834702e",
            
144
    "image_url": "2025-04-15-131843.179987csic.png",
145
    "image_url": "2025-04-15-131843.179987csic.png",
            
145
    "is_organization": true,
146
    "is_organization": true,
            
146
    "name": 
147
    "name": 
            
147
agencia-estatal-consejo-superior-de-investigaciones-cientificas-csic",
148
agencia-estatal-consejo-superior-de-investigaciones-cientificas-csic",
            
148
    "state": "active",
149
    "state": "active",
            
n
149
    "title": "Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones 
n
150
    "title": "CSIC",
            
150
Cient\u00edficas (CSIC)",

            
151
    "type": "organization"
151
    "type": "organization"
            
152
  },
152
  },
            
153
  "owner_org": "e0fb512f-fa1e-43d9-ba1e-22b1f834702e",
153
  "owner_org": "e0fb512f-fa1e-43d9-ba1e-22b1f834702e",
            
154
  "private": false,
154
  "private": false,
            
155
  "proyecto": {},
155
  "proyecto": {},
            
156
  "publisher": "b627d71d-2315-4e75-afc9-897da84459f0",
156
  "publisher": "b627d71d-2315-4e75-afc9-897da84459f0",
            
157
  "reference": [
157
  "reference": [
            
158
    "http://hdl.handle.net/10261/240680"
158
    "http://hdl.handle.net/10261/240680"
            
159
  ],
159
  ],
            
160
  "relationships_as_object": [],
160
  "relationships_as_object": [],
            
161
  "relationships_as_subject": [],
161
  "relationships_as_subject": [],
            
162
  "resources": [
162
  "resources": [
            
163
    {
163
    {
            
164
      "byte_size": "8,07 kB",
164
      "byte_size": "8,07 kB",
            
165
      "cache_last_updated": null,
165
      "cache_last_updated": null,
            
166
      "cache_url": null,
166
      "cache_url": null,
            
167
      "created": "2025-03-04T15:44:08.808809",
167
      "created": "2025-03-04T15:44:08.808809",
            
168
      "datastore_active": false,
168
      "datastore_active": false,
            
169
      "description": null,
169
      "description": null,
            
170
      "format": "txt",
170
      "format": "txt",
            
171
      "hash": "",
171
      "hash": "",
            
172
      "id": "74a37986-f9d9-4084-a3f2-3f101dd6966d",
172
      "id": "74a37986-f9d9-4084-a3f2-3f101dd6966d",
            
173
      "last_modified": null,
173
      "last_modified": null,
            
174
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.309817",
174
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.309817",
            
175
      "mimetype": "text/plain",
175
      "mimetype": "text/plain",
            
176
      "mimetype_inner": null,
176
      "mimetype_inner": null,
            
177
      "name": "README.txt",
177
      "name": "README.txt",
            
178
      "name_translated": {
178
      "name_translated": {
            
179
        "en": "README.txt",
179
        "en": "README.txt",
            
180
        "es": "README.txt"
180
        "es": "README.txt"
            
181
      },
181
      },
            
182
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
182
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
            
183
      "position": 0,
183
      "position": 0,
            
184
      "resource_identifier": 
184
      "resource_identifier": 
            
185
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
185
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
            
186
      "resource_relation": [],
186
      "resource_relation": [],
            
187
      "resource_relation-1": "",
187
      "resource_relation-1": "",
            
188
      "resource_relation-2": "",
188
      "resource_relation-2": "",
            
189
      "resource_type": null,
189
      "resource_type": null,
            
190
      "size": null,
190
      "size": null,
            
191
      "state": "active",
191
      "state": "active",
            
192
      "url": 
192
      "url": 
            
193
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
193
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/2/README.txt",
            
194
      "url_type": null
194
      "url_type": null
            
195
    },
195
    },
            
196
    {
196
    {
            
197
      "byte_size": "2,52 MB",
197
      "byte_size": "2,52 MB",
            
198
      "cache_last_updated": null,
198
      "cache_last_updated": null,
            
199
      "cache_url": null,
199
      "cache_url": null,
            
200
      "created": "2025-03-04T15:44:45.312097",
200
      "created": "2025-03-04T15:44:45.312097",
            
201
      "datastore_active": false,
201
      "datastore_active": false,
            
202
      "description": null,
202
      "description": null,
            
203
      "format": "zip",
203
      "format": "zip",
            
204
      "hash": "",
204
      "hash": "",
            
205
      "id": "7251e3a1-561d-45f8-bc92-b4f9c1b7e379",
205
      "id": "7251e3a1-561d-45f8-bc92-b4f9c1b7e379",
            
206
      "last_modified": null,
206
      "last_modified": null,
            
207
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.431908",
207
      "metadata_modified": "2025-03-04T15:44:45.431908",
            
208
      "mimetype": "application/zip",
208
      "mimetype": "application/zip",
            
209
      "mimetype_inner": null,
209
      "mimetype_inner": null,
            
210
      "name": "CT-EBM-SP.zip",
210
      "name": "CT-EBM-SP.zip",
            
211
      "name_translated": {
211
      "name_translated": {
            
212
        "en": "CT-EBM-SP.zip",
212
        "en": "CT-EBM-SP.zip",
            
213
        "es": "CT-EBM-SP.zip"
213
        "es": "CT-EBM-SP.zip"
            
214
      },
214
      },
            
215
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
215
      "package_id": "3dea13e2-76f7-4170-9e7a-c3dc6accffe8",
            
216
      "position": 1,
216
      "position": 1,
            
217
      "resource_identifier": 
217
      "resource_identifier": 
            
218
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
218
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
            
219
      "resource_relation": [],
219
      "resource_relation": [],
            
220
      "resource_relation-1": "",
220
      "resource_relation-1": "",
            
221
      "resource_type": null,
221
      "resource_type": null,
            
222
      "size": null,
222
      "size": null,
            
223
      "state": "active",
223
      "state": "active",
            
224
      "url": 
224
      "url": 
            
225
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
225
"https://digital.csic.es/bitstream/10261/285045/1/CT-EBM-SP.zip",
            
226
      "url_type": null
226
      "url_type": null
            
227
    }
227
    }
            
228
  ],
228
  ],
            
229
  "spatial": [],
229
  "spatial": [],
            
230
  "state": "active",
230
  "state": "active",
            
231
  "tags": [],
231
  "tags": [],
            
232
  "theme": [
232
  "theme": [
            
233
    
233
    
            
234
"http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/ciencia-tecnologia",
234
"http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/ciencia-tecnologia",
            
235
    "http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/salud"
235
    "http://datos.gob.es/kos/sector-publico/sector/salud"
            
236
  ],
236
  ],
            
n
237
  "title": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
n
237
  "title": "CT-EBM-SP - Corpus de ensayos cl\u00ednicos para la 
            
238
Evidence-Based-Medicine in Spanish",
238
medicina basada en la evidencia en espa\u00f1ol",
            
239
  "title_translated": {
239
  "title_translated": {
            
240
    "en": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
240
    "en": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
            
241
Evidence-Based-Medicine in Spanish",
241
Evidence-Based-Medicine in Spanish",
            
t
242
    "es": "CT-EBM-SP - Corpus of Clinical Trials for 
t
242
    "es": "CT-EBM-SP - Corpus de ensayos cl\u00ednicos para la 
            
243
Evidence-Based-Medicine in Spanish"
243
medicina basada en la evidencia en espa\u00f1ol"
            
244
  },
244
  },
            
245
  "type": "dataset",
245
  "type": "dataset",
            
246
  "url": null,
246
  "url": null,
            
247
  "version": null
247
  "version": null
            
248
}
248
}